Действие этой истории происходит в бывшем Пляжном городке, сумевшем благополучно пережить Великую Самоцветную революцию и последующие «тёмные века». В игре идёт конфликт между загадочным правителем Пляжного городка — мэром Дьюи, Новой Кристальной Республикой, Легионом Алмазов, где каждая из сторон пытается завладеть пончиковой "Большой Поничк" — магазином пончиков, питающей пончиками весь регион.
Главный герой — Кварц, попадает в засаду неизвестной банды и получив пулю в кисталл остаётся умирать в неглубокой могиле. Там его находит и откапывает верный робот-секьюритрон Жемчуг, после чего относит героя в Пляжный городок к местному доктору Приянке Махесваран. Док восстанавливает героя, правда уже в совершенно новой форме, проводит пару опросов и тестов, дарит ему Пип-бой, возвращает его снаряжение и отправляет в путь на Пустошь. Одна из первостепенных задач главного героя — вспомнить своё прошлое и найти тех, кто пытался его убить.